Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTOP3Q7RTS5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP3Q7RTS5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms