Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 SNX14-207ENST00000503491 3491 ntTSL 25.23□□□□□ -1.578e-7■■■■□ 24.8
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SND1Q7KZF4 CD9-205ENST00000481267 1280 ntTSL 517.27■□□□□ 0.363e-7■■■■□ 24.8
SND1Q7KZF4 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.313e-7■■■■□ 24.8
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SND1Q7KZF4 MPDU1-218ENST00000579445 582 ntTSL 38.75□□□□□ -1.015e-9■■■■□ 24.8
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SND1Q7KZF4 SORL1-203ENST00000524873 574 ntTSL 311.56□□□□□ -0.566e-18■■■■□ 24.7
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SND1Q7KZF4 ASAH1-208ENST00000519545 771 ntTSL 35.55□□□□□ -1.522e-9■■■■□ 24.7
SND1Q7KZF4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.053e-7■■■■□ 24.7
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SND1Q7KZF4 CLDN12-202ENST00000394604 846 ntTSL 59.48□□□□□ -0.894e-8■■■■□ 24.7
SND1Q7KZF4 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.964e-8■■■■□ 24.7
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SND1Q7KZF4 CLDN12-206ENST00000451941 527 ntTSL 37.16□□□□□ -1.264e-8■■■■□ 24.7
SND1Q7KZF4 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.44e-8■■■■□ 24.7
SND1Q7KZF4 CLDN12-214ENST00000498033 420 ntTSL 35.18□□□□□ -1.584e-8■■■■□ 24.7
SND1Q7KZF4 ATP1B1-203ENST00000494797 718 ntTSL 211.55□□□□□ -0.561e-10■■■■□ 24.7
SND1Q7KZF4 ATP6AP2-232ENST00000638046 466 ntTSL 25.75□□□□□ -1.493e-7■■■■□ 24.7
SND1Q7KZF4 LGALS3BP-214ENST00000589527 818 ntTSL 314.9□□□□□ -0.022e-35■■■■□ 24.6
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SND1Q7KZF4 MYL6-217ENST00000550639 419 ntTSL 59.91□□□□□ -0.828e-20■■■■□ 24.6
SND1Q7KZF4 CTSH-217ENST00000534533 836 ntTSL 310.7□□□□□ -0.74e-7■■■■□ 24.6
SND1Q7KZF4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.949e-8■■■■□ 24.6
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SND1Q7KZF4 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.044e-8■■■■□ 24.6
SND1Q7KZF4 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.194e-8■■■■□ 24.6
SND1Q7KZF4 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.944e-8■■■■□ 24.6
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SND1Q7KZF4 PRCP-204ENST00000525772 666 ntTSL 37.8□□□□□ -1.162e-9■■■■□ 24.6
SND1Q7KZF4 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.437e-9■■■■□ 24.5
SND1Q7KZF4 LGALS3BP-208ENST00000588198 1132 ntTSL 214.18□□□□□ -0.142e-35■■■■□ 24.5
SND1Q7KZF4 PCOLCE-207ENST00000486440 765 ntTSL 319.28■□□□□ 0.683e-7■■■■□ 24.5
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SND1Q7KZF4 PSEN1-204ENST00000394164 3046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-8■■■■□ 24.4
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SND1Q7KZF4 PSEN1-209ENST00000553855 1254 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.922e-8■■■■□ 24.4
SND1Q7KZF4 PSEN1-211ENST00000554995 592 ntTSL 29.27□□□□□ -0.932e-8■■■■□ 24.4
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SND1Q7KZF4 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.152e-8■■■■□ 24.4
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SND1Q7KZF4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.164e-11■■■■□ 24.4
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SND1Q7KZF4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.595e-8■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.231e-6■■■■□ 24.3
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SND1Q7KZF4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.131e-6■■■■□ 24.3
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SND1Q7KZF4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 CYC1-203ENST00000528618 831 ntTSL 519.22■□□□□ 0.674e-12■■■■□ 24.3
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SND1Q7KZF4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 POGLUT1-208ENST00000497447 1361 ntTSL 217.59■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 ISM2-206ENST00000487738 1076 ntTSL 217.47■□□□□ 0.391e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 SEMA3G-202ENST00000465657 848 ntTSL 316.93■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 24.3
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SND1Q7KZF4 STRA6-216ENST00000573456 760 ntTSL 316.47■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 STRA6-210ENST00000569936 2151 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.181e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.111e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 SEMA3G-203ENST00000475739 616 ntTSL 315.36■□□□□ 0.051e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 ISM2-201ENST00000216481 3045 ntTSL 215□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 GGH-205ENST00000520609 1109 ntTSL 213.2□□□□□ -0.35e-8■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 STRA6-217ENST00000573724 596 ntTSL 313.11□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 POGLUT1-201ENST00000295588 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 TTYH1-217ENST00000492920 757 ntTSL 212.69□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 KRT18-205ENST00000548496 695 ntTSL 212.56□□□□□ -0.44e-12■■■■□ 24.3
SND1Q7KZF4 TMEM97-203ENST00000582113 493 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 24.3
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