Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM236Q5W0B7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM236Q5W0B7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM236Q5W0B7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM236Q5W0B7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM236Q5W0B7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM236Q5W0B7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM236Q5W0B7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM236Q5W0B7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM236Q5W0B7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM236Q5W0B7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM236Q5W0B7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM236Q5W0B7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM236Q5W0B7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1005.4 ms