Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNGA3Q16281 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA3Q16281 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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