Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MRPL28Q13084 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MRPL28Q13084 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MRPL28Q13084 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms