Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRKCDQ05655 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKCDQ05655 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms