Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARL4CP56559 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARL4CP56559 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARL4CP56559 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms