Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTBP2P56545 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 341.2 ms