Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 SMG7-203ENST00000367538 328 ntTSL 221.19■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 SMG7-206ENST00000444547 580 ntTSL 420.81■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 SMG7-204ENST00000419169 2483 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.69■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 SMG7-213ENST00000507691 760 ntTSL 519.62■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-8■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.213e-11■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.93e-11■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 UBE4B-208ENST00000475795 871 ntTSL 58.19□□□□□ -1.13e-11■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 AL390719.1-206ENST00000451054 565 ntTSL 213.69□□□□□ -0.225e-9■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 AL390719.1-205ENST00000433695 540 ntTSL 212.79□□□□□ -0.365e-9■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.1■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 40.5
GTF2F1P35269 FUBP3-203ENST00000467100 2228 ntTSL 225.88■■□□□ 1.737e-8■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.377e-8■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 521.02■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 218.41■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 AP2A2-212ENST00000528195 562 ntTSL 320.42■□□□□ 0.869e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.589e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.419e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 AP2A2-213ENST00000528815 3072 ntTSL 217.05■□□□□ 0.329e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 AC107871.1-201ENST00000637888 2941 ntTSL 520.18■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 AC107871.1-203ENST00000637054 3238 ntTSL 519.6■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.512e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.52e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)24.41■■□□□ 1.52e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)24.41■■□□□ 1.52e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)21.34■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 519.77■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 516.68■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 316.47■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 414.55□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 40.4
GTF2F1P35269 HTT-213ENST00000513806 432 ntTSL 512.17□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 HTT-208ENST00000510626 14438 ntTSL 1 (best)9.66□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 HTT-209ENST00000512068 401 ntTSL 38.54□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.319e-8■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 ELF4-203ENST00000434609 406 ntTSL 316.71■□□□□ 0.279e-8■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 TMEM63A-207ENST00000487971 488 ntTSL 35.68□□□□□ -1.56e-9■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 DCUN1D4-209ENST00000505403 645 ntTSL 424.16■■□□□ 1.463e-7■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 ARHGEF1-223ENST00000617585 737 ntTSL 224.89■■□□□ 1.582e-7■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-10■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-10■■■■■ 40.3
GTF2F1P35269 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.973e-7■■■■■ 40.2
GTF2F1P35269 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.173e-7■■■■■ 40.2
GTF2F1P35269 ZDHHC14-202ENST00000341375 1934 ntTSL 1 (best)19.85■□□□□ 0.773e-7■■■■■ 40.2
GTF2F1P35269 ZDHHC14-209ENST00000523706 5146 ntTSL 215.01□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 40.2
GTF2F1P35269 ZDHHC14-207ENST00000518214 861 ntTSL 311.9□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 40.2
GTF2F1P35269 ZDHHC14-206ENST00000517432 3646 ntTSL 211.85□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 40.2
GTF2F1P35269 ZDHHC14-201ENST00000340347 328 ntTSL 510.06□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 40.2
GTF2F1P35269 CD81-205ENST00000475945 606 ntTSL 220.05■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 CD81-217ENST00000533417 444 ntTSL 320.05■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 CD81-215ENST00000530648 558 ntTSL 414.64□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 SEPT9-215ENST00000586521 601 ntTSL 418.55■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 SEPT9-235ENST00000591020 582 ntTSL 411.89□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.811e-11■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 DCUN1D4-220ENST00000511675 643 ntTSL 227.81■■■□□ 2.043e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 DCUN1D4-211ENST00000506673 548 ntTSL 427.81■■■□□ 2.043e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 DCUN1D4-222ENST00000513800 949 ntTSL 227.81■■■□□ 2.043e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 DCUN1D4-205ENST00000502930 548 ntTSL 427.13■■□□□ 1.933e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 DCUN1D4-213ENST00000507741 1584 ntTSL 224.97■■□□□ 1.593e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 DCUN1D4-206ENST00000504113 594 ntTSL 424.48■■□□□ 1.513e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 DCUN1D4-216ENST00000509376 2293 ntTSL 224.31■■□□□ 1.483e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.283e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 DCUN1D4-204ENST00000477560 4840 ntTSL 25.5□□□□□ -1.533e-7■■■■■ 40.1
GTF2F1P35269 NOL3-212ENST00000568199 613 ntTSL 319.51■□□□□ 0.713e-7■■■■■ 40
GTF2F1P35269 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 40
GTF2F1P35269 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 425.37■■□□□ 1.657e-7■■■■■ 40
GTF2F1P35269 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.197e-7■■■■■ 40
GTF2F1P35269 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.171e-12■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)22.27■■□□□ 1.161e-12■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TTLL3-218ENST00000443148 2031 ntTSL 216.59■□□□□ 0.251e-12■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TTLL3-214ENST00000431204 1041 ntTSL 513.53□□□□□ -0.241e-12■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TTLL3-211ENST00000430390 1674 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.371e-12■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TTLL3-201ENST00000310252 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.59□□□□□ -0.391e-12■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TTLL3-231ENST00000496246 507 ntTSL 412.4□□□□□ -0.421e-12■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TTLL3-232ENST00000496526 5282 ntTSL 212.16□□□□□ -0.461e-12■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TTLL3-202ENST00000383827 4834 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.511e-12■■■■■ 40
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 80.7 ms