RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431204.5

TTLL3-214, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTLL3, Length 1,041 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-214ENST00000431204 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.05■■■□□ 2.4
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TTLL3-214ENST00000431204 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.23■■□□□ 1.95
TTLL3-214ENST00000431204 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.02■■□□□ 1.76
TTLL3-214ENST00000431204 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.97■■□□□ 1.75
TTLL3-214ENST00000431204 NACADO15069 1562 aa25.78■■□□□ 1.72
TTLL3-214ENST00000431204 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.46■■□□□ 1.67
TTLL3-214ENST00000431204 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.4■■□□□ 1.66
TTLL3-214ENST00000431204 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.653e-6■■□□□ 13.3
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TTLL3-214ENST00000431204 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.21■■□□□ 1.63
TTLL3-214ENST00000431204 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.03■■□□□ 1.6
TTLL3-214ENST00000431204 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.91■■□□□ 1.58
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TTLL3-214ENST00000431204 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.79■■□□□ 1.56
TTLL3-214ENST00000431204 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.75■■□□□ 1.55
TTLL3-214ENST00000431204 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TTLL3-214ENST00000431204 SCRIBQ14160 1630 aa24.62■■□□□ 1.53
TTLL3-214ENST00000431204 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.18■■□□□ 1.46
TTLL3-214ENST00000431204 CUX2O14529 1486 aa23.88■■□□□ 1.41
TTLL3-214ENST00000431204 NCAPD3P42695 1498 aa23.78■■□□□ 1.4
TTLL3-214ENST00000431204 ERCC6Q03468 1493 aa23.67■■□□□ 1.38
TTLL3-214ENST00000431204 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.62■■□□□ 1.37
TTLL3-214ENST00000431204 HMGXB3Q12766 1538 aa23.62■■□□□ 1.37
TTLL3-214ENST00000431204 SMARCA2P51531 1590 aa23.57■■□□□ 1.36
TTLL3-214ENST00000431204 SMARCA4P51532 1647 aa23.53■■□□□ 1.36
TTLL3-214ENST00000431204 NESP48681 1621 aa23.42■■□□□ 1.34
TTLL3-214ENST00000431204 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL3-214ENST00000431204 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TTLL3-214ENST00000431204 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TTLL3-214ENST00000431204 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TTLL3-214ENST00000431204 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.32■■□□□ 1.32
TTLL3-214ENST00000431204 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.19■■□□□ 1.3
TTLL3-214ENST00000431204 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.14■■□□□ 1.29
TTLL3-214ENST00000431204 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.1■■□□□ 1.29
TTLL3-214ENST00000431204 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.99■■□□□ 1.27
TTLL3-214ENST00000431204 WDR62O43379 1518 aa22.98■■□□□ 1.27
TTLL3-214ENST00000431204 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.98■■□□□ 1.27
TTLL3-214ENST00000431204 WIZO95785 1651 aa22.81■■□□□ 1.24
TTLL3-214ENST00000431204 TRIM41Q8WV44 630 aa22.8■■□□□ 1.24
TTLL3-214ENST00000431204 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.79■■□□□ 1.24
TTLL3-214ENST00000431204 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.72■■□□□ 1.23
TTLL3-214ENST00000431204 CFTRP13569 1480 aa22.69■■□□□ 1.22
TTLL3-214ENST00000431204 OSCARQ8IYS5 282 aa22.59■■□□□ 1.21
TTLL3-214ENST00000431204 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TTLL3-214ENST00000431204 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TTLL3-214ENST00000431204 PRDM2Q13029 1718 aa22.53■■□□□ 1.2
TTLL3-214ENST00000431204 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TTLL3-214ENST00000431204 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.42■■□□□ 1.18
TTLL3-214ENST00000431204 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.42■■□□□ 1.18
TTLL3-214ENST00000431204 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.42■■□□□ 1.18
TTLL3-214ENST00000431204 IFT140Q96RY7 1462 aa22.37■■□□□ 1.17
TTLL3-214ENST00000431204 ARHGEF11O15085 1522 aa22.31■■□□□ 1.16
TTLL3-214ENST00000431204 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TTLL3-214ENST00000431204 TOPBP1Q92547 1522 aa22.27■■□□□ 1.16
TTLL3-214ENST00000431204 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TTLL3-214ENST00000431204 ABCC8Q09428 1581 aa22.24■■□□□ 1.15
TTLL3-214ENST00000431204 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.23■■□□□ 1.15
TTLL3-214ENST00000431204 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.19■■□□□ 1.14
TTLL3-214ENST00000431204 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TTLL3-214ENST00000431204 CHD1O14646 1710 aa22.14■■□□□ 1.13
TTLL3-214ENST00000431204 ARAP1Q96P48 1450 aa22.07■■□□□ 1.12
TTLL3-214ENST00000431204 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.122e-10■□□□□ 9.7
TTLL3-214ENST00000431204 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.02■■□□□ 1.12
TTLL3-214ENST00000431204 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TTLL3-214ENST00000431204 WDR97A6NE52 1622 aa21.99■■□□□ 1.11
TTLL3-214ENST00000431204 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.91■■□□□ 1.1
TTLL3-214ENST00000431204 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.87■■□□□ 1.09
TTLL3-214ENST00000431204 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TTLL3-214ENST00000431204 SOGA1O94964 1423 aa21.85■■□□□ 1.09
TTLL3-214ENST00000431204 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.84■■□□□ 1.09
TTLL3-214ENST00000431204 SYNJ1O43426 1573 aa21.84■■□□□ 1.09
TTLL3-214ENST00000431204 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TTLL3-214ENST00000431204 FBLN2P98095 1184 aa21.83■■□□□ 1.09
TTLL3-214ENST00000431204 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TTLL3-214ENST00000431204 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.8■■□□□ 1.08
TTLL3-214ENST00000431204 GRIN2BQ13224 1484 aa21.77■■□□□ 1.07
TTLL3-214ENST00000431204 SYNJ2O15056 1496 aa21.74■■□□□ 1.07
TTLL3-214ENST00000431204 CUX1P39880 1505 aa21.74■■□□□ 1.07
TTLL3-214ENST00000431204 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TTLL3-214ENST00000431204 PBRM1Q86U86 1689 aa21.69■■□□□ 1.06
TTLL3-214ENST00000431204 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.63■■□□□ 1.05
TTLL3-214ENST00000431204 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.62■■□□□ 1.05
TTLL3-214ENST00000431204 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-214ENST00000431204 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TTLL3-214ENST00000431204 GRIN2AQ12879 1464 aa21.48■■□□□ 1.03
TTLL3-214ENST00000431204 NUP160Q12769 1436 aa21.46■■□□□ 1.03
TTLL3-214ENST00000431204 ADAMTS12P58397 1594 aa21.46■■□□□ 1.03
TTLL3-214ENST00000431204 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.45■■□□□ 1.02
TTLL3-214ENST00000431204 SHROOM2Q13796 1616 aa21.45■■□□□ 1.02
TTLL3-214ENST00000431204 CEP170Q5SW79 1584 aa21.44■■□□□ 1.02
TTLL3-214ENST00000431204 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
TTLL3-214ENST00000431204 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.37■■□□□ 1.01
TTLL3-214ENST00000431204 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.35■■□□□ 1.01
TTLL3-214ENST00000431204 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.34■■□□□ 1.01
TTLL3-214ENST00000431204 TOP2BQ02880 1626 aa21.33■■□□□ 1.01
TTLL3-214ENST00000431204 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.33■■□□□ 1
TTLL3-214ENST00000431204 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
TTLL3-214ENST00000431204 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.18■□□□□ 0.98
TTLL3-214ENST00000431204 MAPKBP1O60336 1514 aa21.17■□□□□ 0.98
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