Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUSP1P28562 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUSP1P28562 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms