Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU1F1P28069 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms