Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND1P24385 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND1P24385 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND1P24385 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND1P24385 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND1P24385 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND1P24385 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND1P24385 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND1P24385 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND1P24385 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND1P24385 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND1P24385 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND1P24385 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCND1P24385 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCND1P24385 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCND1P24385 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND1P24385 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND1P24385 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND1P24385 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND1P24385 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND1P24385 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND1P24385 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND1P24385 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND1P24385 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND1P24385 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCND1P24385 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCND1P24385 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND1P24385 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND1P24385 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND1P24385 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCND1P24385 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND1P24385 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND1P24385 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND1P24385 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCND1P24385 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND1P24385 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND1P24385 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND1P24385 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND1P24385 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND1P24385 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND1P24385 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCND1P24385 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND1P24385 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND1P24385 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND1P24385 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND1P24385 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND1P24385 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND1P24385 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND1P24385 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCND1P24385 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCND1P24385 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCND1P24385 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND1P24385 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND1P24385 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCND1P24385 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND1P24385 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCND1P24385 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND1P24385 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND1P24385 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND1P24385 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCND1P24385 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND1P24385 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND1P24385 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND1P24385 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND1P24385 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND1P24385 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND1P24385 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND1P24385 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND1P24385 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND1P24385 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCND1P24385 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND1P24385 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND1P24385 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND1P24385 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND1P24385 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND1P24385 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND1P24385 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND1P24385 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND1P24385 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND1P24385 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCND1P24385 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND1P24385 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND1P24385 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND1P24385 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND1P24385 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCND1P24385 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms