Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
LAMC1P11047 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LAMC1P11047 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms