Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCB1P08183 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms