Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NGFRP08138 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NGFRP08138 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NGFRP08138 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NGFRP08138 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NGFRP08138 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NGFRP08138 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NGFRP08138 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NGFRP08138 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NGFRP08138 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NGFRP08138 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NGFRP08138 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NGFRP08138 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NGFRP08138 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NGFRP08138 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NGFRP08138 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NGFRP08138 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NGFRP08138 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NGFRP08138 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NGFRP08138 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NGFRP08138 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NGFRP08138 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NGFRP08138 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NGFRP08138 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NGFRP08138 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NGFRP08138 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NGFRP08138 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NGFRP08138 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NGFRP08138 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NGFRP08138 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NGFRP08138 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NGFRP08138 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NGFRP08138 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NGFRP08138 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NGFRP08138 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NGFRP08138 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NGFRP08138 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NGFRP08138 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NGFRP08138 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NGFRP08138 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NGFRP08138 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NGFRP08138 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NGFRP08138 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NGFRP08138 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NGFRP08138 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NGFRP08138 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NGFRP08138 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NGFRP08138 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NGFRP08138 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NGFRP08138 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NGFRP08138 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NGFRP08138 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NGFRP08138 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NGFRP08138 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NGFRP08138 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
NGFRP08138 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NGFRP08138 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NGFRP08138 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NGFRP08138 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NGFRP08138 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NGFRP08138 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NGFRP08138 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NGFRP08138 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NGFRP08138 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NGFRP08138 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NGFRP08138 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NGFRP08138 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NGFRP08138 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NGFRP08138 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NGFRP08138 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NGFRP08138 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NGFRP08138 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NGFRP08138 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NGFRP08138 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NGFRP08138 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NGFRP08138 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NGFRP08138 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NGFRP08138 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NGFRP08138 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NGFRP08138 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NGFRP08138 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NGFRP08138 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NGFRP08138 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NGFRP08138 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NGFRP08138 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NGFRP08138 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NGFRP08138 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NGFRP08138 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms