Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC4A1P02730 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A1P02730 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A1P02730 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms