Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3O43889 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3O43889 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3O43889 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3O43889 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB3O43889 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3O43889 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3O43889 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB3O43889 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3O43889 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3O43889 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3O43889 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3O43889 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3O43889 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3O43889 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CREB3O43889 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3O43889 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3O43889 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3O43889 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3O43889 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB3O43889 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3O43889 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3O43889 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3O43889 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3O43889 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3O43889 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3O43889 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3O43889 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3O43889 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3O43889 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB3O43889 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3O43889 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3O43889 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3O43889 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3O43889 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3O43889 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3O43889 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3O43889 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3O43889 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3O43889 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3O43889 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB3O43889 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3O43889 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3O43889 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3O43889 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CREB3O43889 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3O43889 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3O43889 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3O43889 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3O43889 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3O43889 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3O43889 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3O43889 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CREB3O43889 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CREB3O43889 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3O43889 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3O43889 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3O43889 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CREB3O43889 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3O43889 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3O43889 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3O43889 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3O43889 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3O43889 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3O43889 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3O43889 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3O43889 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3O43889 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CREB3O43889 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3O43889 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3O43889 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3O43889 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3O43889 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CREB3O43889 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3O43889 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3O43889 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3O43889 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3O43889 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3O43889 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3O43889 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3O43889 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3O43889 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CREB3O43889 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3O43889 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3O43889 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3O43889 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3O43889 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3O43889 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3O43889 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3O43889 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3O43889 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3O43889 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3O43889 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3O43889 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3O43889 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3O43889 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB3O43889 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB3O43889 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB3O43889 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3O43889 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms