Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRXO43186 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRXO43186 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRXO43186 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRXO43186 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRXO43186 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRXO43186 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRXO43186 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRXO43186 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRXO43186 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRXO43186 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRXO43186 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRXO43186 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRXO43186 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRXO43186 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRXO43186 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRXO43186 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRXO43186 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRXO43186 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRXO43186 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRXO43186 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRXO43186 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRXO43186 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRXO43186 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRXO43186 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRXO43186 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRXO43186 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CRXO43186 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRXO43186 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRXO43186 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRXO43186 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRXO43186 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRXO43186 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CRXO43186 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRXO43186 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRXO43186 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRXO43186 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRXO43186 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRXO43186 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRXO43186 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CRXO43186 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRXO43186 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRXO43186 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRXO43186 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRXO43186 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms