Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMX2-CTNND1H3BSU7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMX2-CTNND1H3BSU7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMX2-CTNND1H3BSU7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms