Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SRRM3A6NNA2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRM3A6NNA2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRM3A6NNA2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms