Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL33A6NCF5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms