Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms