Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms