Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms