Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms