Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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CUL4AQ13619 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUL4AQ13619 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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