Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA5AQ13591 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms