Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPN11Q06124 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms