Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED6P86452 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms