Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DESP17661 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DESP17661 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DESP17661 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DESP17661 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DESP17661 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DESP17661 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DESP17661 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DESP17661 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DESP17661 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DESP17661 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DESP17661 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms