Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms