Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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SCN9AQ15858 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCN9AQ15858 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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