Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERCC2P18074 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms