Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C6orf47O95873 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms