Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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