Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGA9Q13797 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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ITGA9Q13797 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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ITGA9Q13797 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGA9Q13797 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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