Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms