Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP104O60308 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP104O60308 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP104O60308 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CEP104O60308 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CEP104O60308 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CEP104O60308 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms