Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA2D2Q9NY47 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms