Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG4AQ8WYN0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms