Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms