Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C9orf135Q5VTT2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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C9orf135Q5VTT2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C9orf135Q5VTT2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C9orf135Q5VTT2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C9orf135Q5VTT2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C9orf135Q5VTT2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C9orf135Q5VTT2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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C9orf135Q5VTT2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf135Q5VTT2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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