Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDO1Q16878 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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