Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms