Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IRF8Q02556 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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IRF8Q02556 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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IRF8Q02556 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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IRF8Q02556 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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