Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DCTN3O75935 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms