Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFIP11Q9UBB9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms