Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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