Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SEC22CQ9BRL7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SEC22CQ9BRL7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SEC22CQ9BRL7 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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